يسعى قطاع الصحة الحيوانية بمركز وقاء إلى تطوير أعمال الوقاية من الأمراض الحيوانية ومكافحتها، وحماية الإنسان والحيوان وبيئتهما المشتركة من مخاطر تلك الأمراض وفق نهج "الصحة الواحدة"، وتبني الاستخدام المسؤول للمستحضرات البيطرية في الوقاية والعلاج، بالإضافة إلى التوسع في استخدام التقنيات والطرق الحديثة للتأهب والإنذار المبكر والاستجابة لتلك الأمراض، وتطبيق أفضل الممارسات العالمية في برامج الوقاية والمكافحة للسيطرة على الاندلاعات الوبائية، والمساهمة في نمو الإنتاج الحيواني المحلي وتعزيز استدامته، والمساهمة في دعم ملاك الثروة الحيوانية بالمملكة.